Если есть у авиакомпаний возможность купить билеты Москва-Дели-Катманду-Дели-Москва, но чтобы стыковка рейсов была не стандартная (в тот же день), а через 2-3 дня?

Если Вы летите в Ктм через Дели скорее всего можно договориться с турфирмой, а если не получиться с турфирмой - то с а\к , просто подтвердите нужную непосредственно в А\к нужную Вам дату вылета.
Или езжайте по земле, тогда проблемы с получением визы не будет, да и настоящую Индию увидите, хотя ехать 2 суток и на перекладных придется